A alegria e a aventura estão de volta ao cinema – com o regresso de Willy! A orca com mais de 3 toneladas que cativou a imaginação do mundo inteiro regressa numa aventura para toda a família, aclamada pela crítica como ainda melhor do que 'Libertem Willy 1'.
De volta à aventura está também o amigo de Willy, Jesse (Jason James Richter), um adolescente que se esforça para se acomodar à nova vida com os seus pais adoptivos, que experimenta os primeiros amores e atura um meio-irmão chamado Elvis. Ele já não espera tornar a encontrar-se com Willy, mas durante umas férias na Costa Noroeste dos Estados Unidos, Jesse encontra uma rapariga muito especial e para sua surpresa reencontra Willy e a nova família deste!
Mas, inesperadamente, um petroleiro encalha na região e começa a derramar petróleo. As baleias ficam presas numa enseada e a situação só piora quando o petróleo se incendeia.
Para salvar a família de Willy, Jesse vai ter de enfrentar um mar de chamas –e esperar que Willy esteja lá para o salvar também!